Пегги продолжает углубляться в запутанные дела СКР, надеясь помочь миру выстоять перед очередными угрозами, исходящими от злодеев. Задержание коварной шпионки Андервуд совпадает во времени с обнаружением трупа ученого. Женщина оказывается любовницей влиятельного политика и владельца Исодин, но теперь от исследовательницы физических частиц остается лишь безжизненное тело. Разведчики, пользуясь отвлеченностью агентов, забирают рассекреченную лазутчицу. Но и будущий сенатор, оплакивающий потерю возлюбленной, сталкивается с потерями.

Загадочный Совет девяти настойчиво ратует за полное прекращение разработки проекта нулевой материи. Интриги плетет жена политика, надеясь отомстить за измену. Начальство уверено, что «Агент Картер» 2 сезон пригодится Говарду Старку. Разработчик переживает последствия наговоров в продаже оружия и самостоятельно собирается пресечь попытки Совета отнять у него плоды многолетней деятельности. За шпионскими страстями участники расследования не знают, что нулевая материя уже проникла в мир. Схватка между заклятыми врагами приводит к тому, что на планете появляется обладатель уникальных способностей. Но как повлияет его энергия на расстановку сил?